Biomedical Imaging Services

从样品制备到三维定量分析

以 PuClear 组织透明化、VISoR 高通量三维成像与自主数据分析工具为基础,提供组织制备、图像采集、三维重建及定量分析服务,支持神经科学、药效评价与系统解剖研究。

30 分钟典型小鼠全脑 VISoR 扫描时间
1 × 1 × 2.5 μm³常规全脑成像的体素尺寸
约 10 天标准全脑成像项目的参考交付周期

Service Portfolio

按研究目标选择成像与分析服务

VISoR 小鼠全脑三维成像与细胞级结构
Wang 等,National Science Review(2019),图 2(局部)· CC BY 4.0
01

小鼠全脑三维成像

在全脑三维空间中定位细胞与纤维,观察荧光信号的整体分布,并在感兴趣脑区查看细胞级结构,为局部发现提供全脑解剖背景。

  • 制样与采集根据样品与标记方案,完成固定、包埋、厚切片、PuClear 透明化及 VISoR 扫描,支持单通道或双通道采集。
  • 采样设置常规全脑成像的体素尺寸为 1 × 1 × 2.5 μm³;重点区域可根据细胞形态与轴突观察需求,选择更小的 XY 采样间距。
  • 数据交付交付切片最大强度投影图、原始图像与拼接重建数据,支持图像检查、三维浏览及后续分析。
单/双通道XY 采样间距可选 0.5 μm三维重建
NEATmap 全脑 c-Fos 阳性细胞识别、统计与差异分析结果
Zheng 等,National Science Review(2024),图 3 · CC BY 4.0
02

c-Fos 全脑定量分析

基于全脑 c-Fos 阳性细胞识别与脑区统计,比较行为、刺激、给药或疾病模型条件下的细胞数量与空间分布。c-Fos 信号间接反映一定时间窗内的神经元激活状态,可为相关脑区筛选提供线索。

  • 细胞识别采用 NEATmap 深度学习流程识别三维图像中的 c-Fos 阳性细胞,输出其在原始图像坐标系中的位置。
  • 脑图谱配准将样品图像配准至 Allen CCFv3 标准脑图谱,按脑区统计阳性细胞数量、密度与分布,支持跨样品比较。
  • 定量结果根据研究设计,提供脑区计数表、全脑细胞分布图、组间差异分析及重点脑区可视化结果,为后续机制验证提供依据。
细胞识别图谱配准分脑区定量
不同细胞类型的完整单神经元形态与全脑投射模式
Nature(2021),图 1(局部)· CC BY 4.0
03

神经环路成像与投射分析

在全脑范围呈现病毒标记的神经投射,分析长程轴突的走行、分支与终末分布,比较不同来源脑区、细胞类型或实验条件下的投射特征。

  • 适用实验适用于顺行或逆行示踪、特定脑区的输入与输出投射研究,以及稀疏标记条件下的单神经元形态观察与重建。
  • 分析内容分析全脑投射路径与各脑区纤维荧光强度,并根据研究目标比较轴突走向、分支结构、靶区分布及形态特征。
  • 数据交付提供全脑投射图谱、各脑区纤维荧光强度统计与投射分布热图;稀疏标记项目可进一步开展单神经元轴突重建。
病毒示踪纤维荧光定量神经元重建
blockface-VISoR 小鼠全身周围神经连续三维成像结果
Cell(2025),图 1(局部)
04

小鼠全身三维成像

在连续三维数据中呈现脑、脊髓、周围神经与器官的空间关系,追踪神经进入器官的路径及分支分布,为器官神经支配和脑—体联系研究提供整体解剖背景。

  • 制样与成像结合 ARCHmap 全身样品制备与 blockface-VISoR 块面体积成像,通过交替进行图像采集与组织切除,获取连续三维数据,呈现大体积样品中的亚细胞结构。
  • 研究对象可观察周围神经、脊神经节、脊髓及多器官结构,支持器官神经支配、跨器官解剖联系与系统性病理变化研究。
  • 数据与分析单通道全身数据量约 70 TB,可根据研究目标开展器官定位、跨器官神经路径追踪、细胞分布统计及定制分析。
约 70 TB/通道亚细胞分辨率多器官连续成像

Research Applications

从成像数据到研究线索

结合标记策略与定量分析,三维成像可用于比较不同实验条件下的细胞分布、神经投射和器官支配模式,为筛选研究对象与设计后续验证实验提供依据。

Deliverables

从原始图像到定量分析结果

根据研究目标与项目阶段,组合基础成像、三维重建和定量分析服务。交付内容支持图像检查、结果统计与后续数据复用,具体范围在方案确认时明确。

NEATmap 全脑 c-Fos 细胞识别、脑区计数与差异分析结果
全脑 c-Fos 阳性细胞分布、细胞识别与脑区定量结果。Zheng 等,National Science Review(2024),图 3;论文原文 · CC BY 4.0

全脑成像数据

支持全脑信号分布检查、局部结构观察与后续三维分析。

  • 各切片最大强度投影图
  • 原始图像与重建三维数据
  • 4 μm / 1 μm / 0.5 μm 重建选项
  • 单通道或双通道图像数据

c-Fos 定量分析结果

提供细胞定位与脑区统计结果,支持跨样品比较和组间差异分析。

  • c-Fos 阳性细胞坐标
  • Allen CCFv3 图谱配准结果
  • 各脑区细胞计数表
  • 三维分布可视化结果

神经投射分析结果

呈现神经投射路径、靶区分布与形态特征,支持脑区间投射比较。

  • 全脑投射路径图谱
  • 各脑区纤维荧光强度统计
  • 投射分布热图
  • 单神经元形态与轴突分支重建结果

全身成像与分析数据

支持全身周围神经、器官神经支配与跨器官解剖联系研究。

  • 全身连续三维图像数据
  • 器官与结构定位
  • 跨器官投射路径与细胞分布分析
  • 按项目需求整理的分析报告

Project Workflow

从方案确认到数据交付

参考交付周期:标准全脑成像项目约 10 天,神经环路项目约 10–15 天,全身成像项目约 60 天。具体周期根据标记方式、样品数量与分析需求,在方案确认时明确。

STEP 01研究目标与方案确认
STEP 02样品接收与质量检查
STEP 03固定、包埋与透明化
STEP 04VISoR 图像采集
STEP 05三维重建、配准与定量
STEP 06数据交付与技术支持

讨论您的成像与分析需求

告诉我们样品类型、标记方式、采集通道与研究目标,技术团队将协助确定适用的组织制备、成像及分析方案。

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